น้ำยาบ้วนปากมักจะมีส่วนผสมสำคัญคือ ยาฆ่าเชื้อโรคและสารที่ทำให้มีกลิ่นหอม ช่วยให้ลมปากหอม สะอาด สดชื่น แต่ผลจะคงอยู่แค่ชั่วคราวเท่านั้น  เนื่องจากในปากมีเชื้ออยู่มากมายหลายชนิด และยาฆ่าเชื้อก็มีฤทธิ์ในการทำลายเชื้ออย่างอ่อนๆ เท่านั้น ถ้าใช้น้ำยาบ้วนปากที่ฆ่าเชื้อแบคทีเรียที่เข้มเกินไป อาจส่งผลต่อสมดุลของเชื้อในช่องปากให้เสียไป เชื้อราจะเติบดตขึ้นบนลิ้น เพดานปาก หรือกระพุ้งแก้มได้

ดังนั้น เพื่อไม่ให้น้ำยาบ้วนปาก เข้าไปกลบหรือปิดบังกลุ่มอาการของโรคในช่องปาก เพราะโรคในช่องปากหลายอาการนั้นจะแสดงอาการออกมาเมื่อมีกลิ่นปาก ช่วยเตือนให้รู้ตัวว่าเหงือกและฟันกำลังมีปัญหา แต่เมื่อฤทธิ์ของน้ำยาบ้วนปากไปทำลายกลิ่นปากที่จะช่วยบอกถึงปัญหาที่จะเกิดขึ้นแล้ว เราก็จะไม่รู้ว่าเหงือกและฟันของเรากำลังจะมีปัญหาค่ะ